Od leta 1993 je zaposlena na Univerzi v Ljubljani. Sodeluje (ali je sodelovala) pri predmetih: Rokomet, Odnosi z javnostmi v športu in na predmetu Management v športu. Njena bibliografija obsega preko 180 strokovnih in znanstvenih ter poljudnih del, med drugim je soavtorica štirih knjig. Sodeluje na znanstvenih in strokovnih posvetih in kongresih doma in v tujini. Sodeluje tudi z Ministrstvom za zdravje in OKS – ZŠZ pri organizacije Evropskega tedna športa. Bila je programski koordinatorica posveta. Kaj je zdrav šport mladih (2017, 2018).Strokovno delovanje: Bila je trikrat selektorica slovenske ženske reprezentance, dosegla prvo medaljo (bron na sredozemskih igrah 1996 in nato še srebro 2015) in prvo uvrstitev na svetovno prvenstvo).Bila je tudi selektorica ženske reprezentance Švice. Bila je predsednica Strokovnega sveta RZS in do leta 2010 članica Predsedstva RZS. Bila je članica odbora za vrhunski šport pri OKS. Do leta 2017 je bila podpredsednica vladnega strokovnega sveta za šport. Je članica strokovnega sveta RZS in predsednica odbora za šport pri MOL.

Marta Bon že več kot desetletje sodeluje pri izobraževanju in usposabljanju strokovnih kadrov v športu v Sloveniji; je tudi članica Akreditacijske komisije. .Mednarodno delovanje: Marta Bon sodeluje z nekaj univerzami v tujini, je članica mednarodnega projekta za dvojno kariero v športu (AMID). Je tudi predavateljica (Lector EHF) v okviru Evropske rokometne zveze. Bila je je skupine za ženski rokomet (Women’s Handball Board) v okviru EHF in sodelavka International handball federation (IHF). Trenutno je članica Strokovnega sveta (Method Commision) v okviru EHF. Sodeluje pri usposabljanju trenerjev v različnih Evropskih državah.